Building R软件包和错误“ ld:找不到-lgfortran”

|| 我正在尝试安装Lars软件包。 Ubuntu 11.04 Natty 64位。从建筑物中我得到:
* installing *source* package âlarsâ ...
** libs
gfortran   -fpic  -O3 -pipe  -g -c delcol.f -o delcol.o
gcc -shared -o lars.so delcol.o -lgfortran -lm -L/usr/lib64/R/lib -lR
/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran
collect2: ld returned 1 exit status
make: *** [lars.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package âlarsâ
gfortran已安装,当我运行
gfortran --version
时,我得到   gfortran --version GNU Fortran   (Ubuntu / Linaro 4.5.2-8ubuntu4)4.5.2
sudo ldconfig -v
给出错误   /sbin/ldconfig.real:无法统计/usr/lib/libgfortran.so:无此类文件或目录 我已经删除并重新安装了gfortran。我需要解决什么?     
已邀请:
        对于Debian / Ubuntu系列,我们通常建议
 $ sudo apt-get install r-base-dev
因为它提取了编译通常所需的所有软件包。而且,由于自动化的软件包构建者依赖于此方法(以及其他基于软件包的Build-Depends),因此该方法一直受到测试。 listed4ѭ软件包也在此处列出;也许您以前的安装中的链接断开了,所以我也尝试
dpkg --purge gfortran; apt-get install gfortran
。也就是说,数十个R软件包(和R本身)都使用Fortran,因此这里不应该有任何魔术。     
        尝试在Ubuntu 12.10 64位上安装CRAN软件包VGAM时遇到相同的问题。我已经安装了r-base-dev,但是Andrew Redd对Dirk Eddelbuettel的回答的第二条评论对我有用。 具体来说,我遇到了两个错误:
/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran
/usr/bin/ld: cannot find -lquadmath
由行固定的:
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3 /usr/lib/libgfortran.so
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0 /usr/lib/libquadmath.so
请注意,只需要第一行就可以解决原始帖子中的问题。第二行修复了我与lquadmath有关的其他错误。     
        看起来其他建议已经解决了您的问题,但是您的问题也适用于我,但是在我的情况下解决方案有所不同。我的问题是我的gcc和g ++版本与gfortran版本不同。我使用以下内容来切换它们,以使它们都相同。 检查您拥有的gcc,g ++和gfortran版本:
g++ --version
gcc --version
gfortran --version
匹配它们,使它们都相同:
sudo update-alternatives --config g++
sudo update-alternatives --config gcc
sudo update-alternatives --config gfortran
就我而言,我只有一个版本的gfortran,因此我只是更改了g ++和gcc版本以匹配gfortran。     
        在ubuntu 12.04,R3.1.0,x86 32位系统上安装R软件包minqa时遇到相同的问题(实际上这是插入符号软件包安装的一部分)。 解决者
sudo ln -s /usr/lib/i386-linux-gnu/libgfortran.so.3 /usr/lib/libgfortran.so
无法重新安装r-base-dev,并且由于所有依赖性,我也没有尝试重新安装gfortran。 根据系统/版本,
ls -l /usr/lib/libgfortran.so
检查链接是否存在/正确。     
        我使用Centos,但无法获得r-base-dev。我还安装了gfortran,其版本与gcc和g ++的版本匹配;它仍然没有工作。但是,我通过创建creating12ѭ解决了这个问题,
cd ~
mkdir .R
touch Makevars
我找到了安装gfortran的目录(显然,问题是R找不到)
which gfortran
它说我在15英镑安装了gfortran。 然后我在
.R/Makevars
中添加了标记以告诉R使用:
F77 = /usr/bin/gfortran
FC = $F77
FLIBS = -L/usr/bin/gfortran
您可以通过以下方式编辑Makevars文件:
vi .R/Makevars
现在,您已进入可以编辑文本文件的“ 19”程序。输入
i
进行编辑;您将在终端窗口的底部看到
INSERT
。然后,您可以输入我上面所说的内容。要保存更改并退出
vi
,请按esc键,然后键入
:wq
。 我不确定我是否正确放置了FLIBS行,因为对于MacOS,这是非常不同的。在MacOS中,gfortran下有一个目录,该目录具有可链接到的库,但是
gfortran
显然不是Linux中的目录。至少这对我有用,并且还解决了ѭ25的问题,所以我顺利安装了需要gfortran的R软件包。     
        就像我的案例(Amazon Linux EC2 AMI)一样,仅将其留在此处以供将来参考,问题仅在于符号链接的命名,而不在于其位置。
sudo ln -s /usr/lib64/libgfortran.so.3 /usr/lib64/libgfortran.so
sudo ln -s /usr/lib64/libquadmath.so.0 /usr/lib64/libquadmath.so
    
        我不必安装任何库。发布对我有用的内容,也许对某人有用。 我有
~/.R/Makevars
定义要使用
CC=gcc-8
。 我的机器上的默认gcc是7.4.0,但是我安装了gcc-8。 同时,我没有gfortran 8,但只有7.4.0。 注释掉Makevars中的这一行会使编译回退到使用默认的gcc-7,然后它成功地使用了gfortran-7 lib。     
        如果您使用的是gcc44,则需要:
yum install gcc44-gfortran
    
        对于将来迷失的灵魂,它还有助于验证所有匹配的编译器版本(根据https://askubuntu.com/questions/276892/cannot-find-lgfortran)。在我的情况下,gcc和gfortran均为4.8.4,但g ++为4.6。     
对于在Mac上访问此页面时遇到相同错误的任何人,请尝试以下操作: 安装Homebrew并运行:
brew install gcc
然后,创建一个包含内容的文件
~/.R/Makevars
(请注意,这对应于gcc版本9.1.0):
VER=-9
CC=gcc$(VER)
CXX=g++$(VER)
CFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
CXXFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
FLIBS=-L/usr/local/Cellar/gcc/9.1.0/lib/gcc/9
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