如何有效地应用数据库中巨大列表的多个位置更改？

我有一个巨大的简单对象的java列表，存储在数据库中，通过索引列维护元素的位置。我使用hibernate但是自己管理列表，因为它太大而无法存储为集合。 在对列表进行一些更改（添加，删除，移动）之后，我想通过手动更新索引列并通过hibernate插入新的分别删除元素来持久保存数据库中的更改。 现在，（1）是否有一种有效的算法如何将列表增量与尽可能少的sql语句相结合 - 或者（2）我是否必须记录每个更改并逐步应用它？