如何改进该算法?

| Windows 7上的R版本2.11.1 32位 我得到数据train.txt如下:
USER_A USER_B ACTION
1        7      0
1        8      1
2        6      2
2        7      1
3        8      2
我将数据作为以下算法处理:
train_data=read.table(\"train.txt\",header=T)
result=matrix(0,length(unique(train_data$USER_B)),2)
result[,1]=unique(train_data$USER_B)
for(i in 1:dim(result)[1])
{
    temp=train_data[train_data$USER_B%in%result[i,1],]
    result[i,2]=sum(temp[,3])/dim(temp)[1]
}
结果是train_data中每个USER_B的得分。分数定义为: USER_B的分数=(USER_B的所有ACTION的总和)/(USER_B的推荐时间) 但是train_data很大,可能需要三天才能完成此程序,所以我来这里寻求帮助,是否可以改进此算法?     
已邀请:
运行您的示例,您想要的结果是计算每个唯一USER_B的平均ACTION:
     [,1] [,2]
[1,]    7  0.5
[2,]    8  1.0
[3,]    6  2.0
您可以使用软件包
plyr
中的
ddply()
函数用一行代码来完成此操作
library(plyr)
ddply(train_data[, -1], .(USER_B), numcolwise(mean))

  USER_B ACTION
1      6    2.0
2      7    0.5
3      8    1.0
或者,基数R中的函数
tapply
执行相同的操作:
tapply(train_data$ACTION, train_data$USER_B, mean)
根据表的大小,执行时间可以提高20倍或更多。这是具有一百万个条目的data.frame的system.time测试。您的算法需要116秒,ddply()需要5.4秒,而tapply需要1.2秒:
train_data <- data.frame(
        USER_A = 1:1e6,
        USER_B = sample(1:1e3, size=1e6, replace=TRUE),
        ACTION = sample (1:100, size=1e6, replace=TRUE))

yourfunction <- function(){
    result <- matrix(0,length(unique(train_data$USER_B)),2)
    result[,1] <- unique(train_data$USER_B);
    for(i in 1:dim(result)[1]){     
        temp=train_data[train_data$USER_B%in%result[i,1],]
        result[i,2]=sum(temp[,3])/dim(temp)[1]
    }
    result
}

system.time(XX <- yourfunction())
   user  system elapsed 
 116.29   14.04  134.33 

system.time(YY <- ddply(train_data[, -1], .(USER_B), numcolwise(mean)))
   user  system elapsed 
   5.43    1.60    7.19 

system.time(ZZ <- tapply(train_data$ACTION, train_data$USER_B, mean))
   user  system elapsed 
   1.17    0.06    1.25 
    
除了@Andrie提供的方法外,“ 9”到“ 10”的方法仍然更快:
> system.time(ZZ <- tapply(train_data$ACTION, train_data$USER_B, mean))
   user  system elapsed 
  1.025   0.011   1.062 
> system.time(WW <- unlist(lapply(split(train_data$ACTION, 
+                                       f = train_data$USER_B), 
+                          mean)))
   user  system elapsed 
  0.465   0.007   0.483
sapply()
同样可以解决这个问题:
> system.time(SS <- sapply(split(train_data$ACTION, f = train_data$USER_B), 
+                          mean))
   user  system elapsed 
  0.469   0.001   0.474
    
@gavin在结合使用
split
lapply
时表现出了很高的性能。
data.table
封装使性能进一步显着提高了〜75%
library(data.table)
system.time({
      VV <- as.data.table(train_data)[, list(ACTION=mean(ACTION)), by=USER_B]
    })

user  system elapsed 
0.15    0.02    0.17 

system.time(WW <- unlist(lapply(split(train_data$ACTION, f = train_data$USER_B),mean)))

user  system elapsed 
0.61    0.02    0.63 

all(WW==VV$ACTION)
[1] TRUE
RAN16ѭ包可在CRAN获得,并在r-forge上拥有网站     
您可以尝试
tapply
train_data <- read.table(\"train.txt\",header=T);
result <- tapply(train_data$ACTION,train_data$USER_B,function(x) sum(x)/length(x)); 
您可以使用ѭ21来代替ѭ22,但是我最近读到这最后一个解决方案更快(如果您没有any23等等)。 我还没有测试过,但我认为应该会更快。如果您想要更快的解决方案,请查看
Rcpp
inline
软件包...     

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